Le pavillon est à la fois une obligation réglementaire et un signe de courtoisie en mer. Le pavillon national est obligatoire en navigation internationale et doit être arboré à la poupe ou au mât de pavillon lors des entrées et sorties de port. Dans les eaux étrangères, le pavillon de courtoisie du pays visité se hisse à tribord dans le gréement.
Au-delà de l'obligation légale, les pavillons régionaux, sportifs ou de club permettent d'exprimer une appartenance ou une identité maritime. Les pavillons réglementaires, qu'ils soient alphabétiques, numériques, bravo de plongée ou Q de libre pratique ont chacun une signification précise dans le code international des signaux. Leur bonne utilisation est une marque de compétence maritime.
La qualité d'un pavillon se juge à sa résistance aux UV et au vent : les tissus en nylon ou en polyester traité résistent mieux que le coton traditionnel dans les conditions marines. Des hampes de pavillon adaptées à chaque emplacement (mât, balcon arrière, tangon) complètent le dispositif.